《规划》指出，“十三五”期间，昆明市医疗卫生服务体系建设成效显著，但仍存在卫生人力资源总量不足、结构不优，公共卫生机构体系不健全，疾控防疫能力待提升，医疗卫生资源区域分布不均衡、结构不合理，医疗卫生机构服务能力水平与人民群众的需求还有一定差距等问题。
《规划》称，随着磨憨—磨丁合作区的建设发展，昆明市国际交流日益增多，南亚东南亚国家疾病预防控制能力参差不齐，对昆明市跨境和新发传染病监测预警及应急处置能力提出了更高的要求。医疗保障政策的优化调整，对全市医疗卫生机构加速转变发展模式、提高存量床位使用效率提出了更现实的要求。
《规划》提出，到2025年，基本建成与昆明市经济社会发展水平相适应，与居民健康需求相匹配的体系完整、布局合理、分工明确、功能互补、密切协作、优质高效的整合型医疗卫生服务体系。高效快捷的公共卫生服务能力明显提升，优质均衡的医疗服务体系更加完备，特色鲜明的中医药服务体系更加健全，全方位全周期健康服务体系逐步完善，医学科技水平和创新能力不断提升，卫生健康服务国际化、现代化水平全面提升，居民身心健康素质明显提高。
《规划》从机构、床位、卫生人力资源、设施设备、技术与学科、信息6大资源要素进行优化布局。其中提出，到2025年，公立医院中市属医院全部达到三级甲等水平，县级综合医院争创三级医院，所有县级综合医院全部达到二级甲等及以上水平;全市每千人口医疗卫生机构床位数的预期性指标为8.33张;力争每万人口全科医生数达到2.94人、每千人口药师(士)数达到0.54人、每万人口公共卫生人员数达到9.75人。
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